Nun ja, es wird wohl ungewöhnliche Anwendungsfälle geben, für die StaxRip eher ungeeignet ist. Spezielle Player-Kompatibilität kann so ein Kriterium sein.
Vielleicht noch ein paar Vorschläge zum weiteren Experimentieren: Für Konverter-GUIs mit AviSynth-Basis gäbe es als Alternative noch MeGUI (aber Vorsicht, das ist noch mal deutlich technisch komplexer, dafür aber auch noch erheblich flexibler); für Multi-Platform-Konverter auf Basis von ffmpeg (und evtl. bald auch VapourSynth) wäre noch Hybrid von Selur verfügbar (ist aber auch nicht so ganz simpel wie Handbrake, vermute ich).