mkvmerge sollte auch fertige MP4 lesen und konvertieren können.
habe ich schon versucht! lesen und remuxen funktioniert, aber die stotterer sind immer noch da! heisst das, dass der konvertierte x264-stream kaputt ist oder dass er beim muxen von mp4box kaputt gegangen sein könnte?
edit: hab mir spasseshalber mal den kmplayer runtergeladen und da sieht das ganze schon wieder ein wenig anders aus! die *.mp4 spielt er an der defekten stelle einfach nur langsamer ab (sieht aus wie halbe geschwindigkeit).