In StaxRip speichere ich regelmäßig mehrere Jobs und lasse diese im Hintergrund durchlaufen. Allerdings poppt bei jedem Wechsel zum nächsten Job ein Fenster auf, das dem aktuell offenen Fenster den Fokus stiehlt. Dabei macht es keinen Unterschied, ob in den Settings "minimized window" gewählt ist oder nicht.
Das beschriebene Verhalten ist besonders ärgerlich, weil ich meinen "StaxRip-encoding-PC" auch als Multimediamaschine zum Filme gucken benutze. Bei jedem Jobwechsel von StaxRip ist dann der Fullscreen meines Videos komplett weg. Egal ob ich (das von mir bevorzugte) XBMC als Player benutze oder VLC.
Das ganze läuft übrigens unter Windows 7 (64bit). Übrigens die Tipps vonwegen "mit TweakUI das 'Don't Steal Focus'" zu unterbinden klappt seit Windows 7 nicht mehr.
Würde mich freuen, wenn jemand eine Idee hat!