Ich habe das Problem, dass Megui das angegebene audio delay nicht berücksichtigt.
Hier mal die commandline aus dem log file.
"mp4box.exe" -add "E:\video.mp4" -add "E:audio.mp4:delay=-1000" -fps 25 -tmp D:\ -new "D:\-1000.mp4"
Vieleicht kann einer helfen.