Es gibt speziell auf Windows optimierte Varianten von ffmpeg, die AviSynth-Skripte lesen können, weil sie das Windows überlassen.
Die meisten Varianten von ffmpeg, die nur plattformübergreifende Funktionen implementieren, wollen alle Dateien selber lesen, und weil AviSynth-Skripte nur Textdateien sind, verstehen sie diese nicht als Videoquelle. Das geht nur, wenn sie sich die Skripte von Windows "vorlesen lassen".
Die ffmpeg-Version, die in der MeGUI benutzt wird, sollte dazu in der Lage sein, wie man aus der Ausgabe von "ffmpeg.exe -formats" lesen kann.
Die Variante von Donald Graft hat nur spezielle MPEG4-AVC-Routinen, aber keine AviSynth-Unterstützung.