Die Entwicklung von VirtualDubMod wurde doch schon längst abgebrochen, weil der Matroska-Kontainer im Vergleich zu AVI so viele Änderungen in der Handhabung erfordert hätte, dass eine reine Modifikation von VirtualDub viel zu aufwändig geworden wäre.
Und das Avery Lee selber das mal umsetzen würde, halte ich für "extrem unwahrscheinlich".